Необходимо расширить диск у уже существующей виртуальной машины. В этом случае воспользуйтесь кнопкой редактирования диска. Обратите внимание, что операция расширения диска расширит только сам диск, но не файловую систему на нем. После расширения диска необходимо еще выполнить resize2fs с этим диском внутри вашего VDS. Полный текст: https://www.netangels.ru/support/cloud-vds/faststart/